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Acabou de ser publicado o artigo com os dados do meu mestrado sobre o desenvolvimento de uma bolacha-do-mar na revista científica de acesso aberto PLoS ONE. O trabalho, escrito em inglês, é ilustrado com 16 pranchas (que incluem muitas das fotos daqui) e 10 cortes de vídeo com cenas do ciclo de vida deste equinodermo (mais ou menos as cenas inclusas neste vídeo); ainda tem uma larva em 3D de bônus. 😀

Embryonic, Larval, and Juvenile Development of a Sea Biscuit

O artigo é livre para ser lido, comentado, baixado e re-usado de acordo com a licença de atribuição da Creative Commons (ver detalhes). Espero que gostem:

Embryonic, Larval, and Juvenile Development of the Sea Biscuit Clypeaster subdepressus (Echinodermata: Clypeasteroida)
Bruno C. Vellutini & Alvaro E. Migotto
http://www.plosone.org/article/info:doi/10.1371/journal.pone.0009654

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O site Virtual Urchin da Universidade de Standford tem uma série de tutoriais interativos envolvendo diversos aspectos da biologia de ouriços-do-mar. Os assuntos abrangem a anatomia, predação e desenvolvimento. No mês passado foi lançada uma atividade sobre a acidificação dos oceanos e suas consequências para os organismos marinhos com esqueleto calcário que inclui o vídeo Vida de Bolacha para exemplificar o ciclo de vida de equinodermos.

Ciclo de vida dos equinodermos no Virtual Urchin.

Ciclo de vida dos equinodermos no Virtual Urchin.

Para conhecer visite virtualurchin.stanford.edu/AcidOcean.htm

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No fim de 2008 recebi uma mensagem da netlabel rec72 com a proposta de criar uma experiência visual (videoclipe) com as imagens do Vida de Bolacha. A trilha sonora seria uma música do álbum “The Scientific Method, Volume II Experiments in Sound Perspective” do Professor Kliq.

Aproveitando o começo de 2009 me aventurei na edição das imagens. Usei o mesmo editor que havia usado no “Vida de Bolacha”, o Open Movie Editor, para linux. Como nunca tinha precisado de efeitos ou transições mirabolantes este programa deu para o gasto (i.e., importar, editar, inserir gráficos, transições simples, e finalmente exportar sem grandes impedimentos). Agora, para criar uma experiência visual resolvi experimentar efeitos adicionais (frei0r). Escolhi a faixa “Dream Sequence”, pois cria um clima interessante, e fui experimentando.

Aos poucos o vídeo foi tomando forma, eu fui descartando diversas tomadas e selecionando as definitivas, e por fim decidi finalizá-lo. É uma experiência visual, portanto não tem ordem, as vezes fica psicodélico e aquela coisa toda… Depois de alguns problemas técnicos com os efeitos (e com o editor) o resultado foi ao ar no dia 16 de março de 2009, e você pode conferir abaixo.

Dream Sequence / NeLaS & Professor Kliq from rec72 on Vimeo.

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The video A Sea Biscuit’s Life was played about 7000 times between November 17 and 18 and about 1500 visitors accessed the page yesterday (18/11). These numbers might not be expressive compared to Internet successes, but it is way beyond I was expecting!

I would like to thank everybody who left comments, sent messages and watched the video on the las 2 days! Specially those who helped with the promotion forwarding and writing about the video. I was really surprised with the repercussion and people’s enthusiasm, which made me quite happy.

I also would like to say that this video could not have been made without this great multimedia enthusiast of marine life, Alvaro Migotto.

And let this be only the beginning!

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It is my pleasure to announce that the video A Sea Biscuit’s Life is online! The video is about the life cycle of the sea biscuit Clypeaster subdepressus and includes footage of embryos, larvae and juveniles. It is part of my master’s thesis.

Watch the video!
mestrado.organelas.com/en/videos

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It was already time to speak out!

Well, this site was created to promote resources I’m producing during my graduate program (masther’s degree). Resources are mainly composed of photos and videos from the sea biscuit Clypeaster subdepressus from São Sebastião Channel (São Paulo, Brasil) during its development.

After 2 months of learning, installing, configuring, debugging, etc… I think this site is now ready to host these resources.

The site is organized in 2 parts. The gallery will host photos and videos and the blog where I’m going to put information about my project, evolution, tutorials, how to make videos, prepare photos, fertilize echinoderms…! It is also by the blog that you can interact with me leaving your comments on the posts. You can also contact me directly through the contact page.

Please send me suggestions for this site navigability or if you find any problems to visualize photos, videos or pages!

Resources will started to be uploaded on the second half of August for academic reasons.

For a start we have a video and an image!

This site content is free for academic uses. Please read carefully the terms of use and if you have any questions please contact me!

But who am I? Look here or browse through my personal website!

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Pluteus larva

Pluteus larva

Ventral view of a Clypeaster subdepressus larva under confocal microscopy. Material is a whole-mount of larvae ~36h after fertilization stained with carmine. After capturing a stack of images with a confocal microscope, the information of depth was codified to colors in a way that structures that have the same color are in the same focal plane. Afterwards, a projection combining allimages from the stack was created.

The stack was taken by A.S. de Souza from Instituto Butantan during a class from Toshie Kawano.

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